1.     Здійснення керівництва діяльністю Відділу, організація роботи Відділу і забезпечення виконання покладених на нього функцій та завдань; розподіл обов’язків між працівниками Відділу, контролю за їх роботою.

2.     Забезпечення ефективної взаємодії Відділу з Міністерством фінансів України, іншими державними органами, підприємствами, установами і організаціями, громадськими об’єднаннями та науковими організаціями при розв’язанні питань, що стосуються діяльності Відділу.

3.     Забезпечення розроблення внутрішніх документів з питань внутрішнього аудиту, планування діяльності з внутрішнього аудиту, проведення та документування результатів внутрішніх аудитів, підготовки аудиторських програм та звітів, висновків, рекомендацій, організація здійснення моніторингу результатів впровадження рекомендацій за результатами проведених внутрішніх аудитів.

4.     Забезпечення в межах компетенції виконання вимог щодо збереження державної таємниці відповідно до Закону України «Про державну таємницю», вживання заходів щодо збереження службової інформації у Відділі дотримання працівниками Відділу законодавства з питань державної служби та запобігання і протидії корупції, правил службового розпорядку.

5.     Забезпечення подання Голові АРМА аудиторських звітів, висновків та рекомендацій для прийняття ним відповідних управлінських рішень.

6.     Організація підготовки і подання зведеного звіту про результати діяльності за формою, затвердженою Міністерством фінансів України, відповідно до вимог постанови Кабінету Міністрів України від 28.09.2011 № 1001 «Деякі питання здійснення внутрішнього аудиту та утворення підрозділів внутрішнього аудиту»; здійснення заходів щодо усунення виявлених Міністерством фінансів України порушень і недоліків, установлених за результатами зовнішньої оцінки якості внутрішнього аудиту.

7.     Забезпечення письмового інформування Голови АРМА про виявлення під час проведення внутрішнього аудиту факту нецільового використання бюджетних коштів, зловживання службовим становищем, порушень фінансово-бюджетної дисципліни, які призвели до втрат чи збитків та/або які мають ознаки кримінального правопорушення, для вжиття відповідних заходів реагування.

8.     Забезпечення здійснення внутрішньої оцінки якості внутрішнього аудиту, моніторингу діяльності з внутрішнього аудиту та інформування Голови АРМА про її результати, щорічне складання програми підвищення якості внутрішнього аудиту, її підписання і затвердження Головою АРМА, забезпечення її виконання.

9.     Забезпечення здійснення оцінки ступеню ризиків від впровадження  діяльності АРМА та відбору об'єктів для проведення планових внутрішніх аудитів.